Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stt3bQ3TDQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Stt3bQ3TDQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stt3bQ3TDQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms