Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp1aQ2LKU9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlrp1aQ2LKU9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms