Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc162pQ0VG85 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc162pQ0VG85 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc162pQ0VG85 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms