Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Htr1fQ02284 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Htr1fQ02284 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Htr1fQ02284 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Htr1fQ02284 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Htr1fQ02284 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Htr1fQ02284 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr1fQ02284 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Htr1fQ02284 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms