Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba1Q02053 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba1Q02053 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba1Q02053 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba1Q02053 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba1Q02053 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uba1Q02053 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba1Q02053 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms