Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sec23aQ01405 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sec23aQ01405 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sec23aQ01405 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sec23aQ01405 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms