Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrcdQ00LT2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrcdQ00LT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms