Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mesp1P97309 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mesp1P97309 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms