Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arf6P62331 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arf6P62331 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arf6P62331 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arf6P62331 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arf6P62331 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arf6P62331 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arf6P62331 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf6P62331 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arf6P62331 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arf6P62331 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf6P62331 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf6P62331 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf6P62331 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arf6P62331 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arf6P62331 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms