Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ActbP60710 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ActbP60710 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ActbP60710 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ActbP60710 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ActbP60710 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ActbP60710 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ActbP60710 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ActbP60710 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ActbP60710 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ActbP60710 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ActbP60710 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ActbP60710 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ActbP60710 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ActbP60710 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ActbP60710 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ActbP60710 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ActbP60710 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ActbP60710 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ActbP60710 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ActbP60710 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ActbP60710 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ActbP60710 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ActbP60710 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ActbP60710 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ActbP60710 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ActbP60710 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ActbP60710 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ActbP60710 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ActbP60710 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ActbP60710 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ActbP60710 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ActbP60710 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ActbP60710 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ActbP60710 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ActbP60710 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ActbP60710 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ActbP60710 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ActbP60710 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ActbP60710 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ActbP60710 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ActbP60710 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ActbP60710 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ActbP60710 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ActbP60710 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ActbP60710 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ActbP60710 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ActbP60710 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ActbP60710 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ActbP60710 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ActbP60710 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ActbP60710 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ActbP60710 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ActbP60710 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ActbP60710 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ActbP60710 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ActbP60710 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ActbP60710 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ActbP60710 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ActbP60710 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ActbP60710 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ActbP60710 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ActbP60710 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms