Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup43P59235 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup43P59235 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup43P59235 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup43P59235 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup43P59235 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup43P59235 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup43P59235 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup43P59235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup43P59235 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup43P59235 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup43P59235 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup43P59235 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup43P59235 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup43P59235 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup43P59235 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup43P59235 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup43P59235 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup43P59235 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup43P59235 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup43P59235 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup43P59235 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup43P59235 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nup43P59235 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup43P59235 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup43P59235 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup43P59235 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup43P59235 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup43P59235 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup43P59235 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup43P59235 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup43P59235 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup43P59235 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup43P59235 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup43P59235 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup43P59235 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup43P59235 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup43P59235 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup43P59235 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup43P59235 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup43P59235 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup43P59235 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms