Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P58686 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P58686 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
P58686 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P58686 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P58686 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
P58686 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
P58686 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P58686 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
P58686 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
P58686 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P58686 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P58686 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P58686 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P58686 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P58686 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
P58686 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P58686 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P58686 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P58686 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P58686 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P58686 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P58686 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P58686 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P58686 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P58686 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
P58686 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P58686 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P58686 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P58686 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P58686 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P58686 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
P58686 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
P58686 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P58686 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P58686 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
P58686 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P58686 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
P58686 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
P58686 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P58686 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P58686 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P58686 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P58686 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P58686 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P58686 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P58686 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P58686 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P58686 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P58686 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P58686 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P58686 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
P58686 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P58686 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P58686 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P58686 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P58686 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P58686 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P58686 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P58686 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P58686 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P58686 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
P58686 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P58686 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P58686 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P58686 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P58686 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms