Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmoP56726 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmoP56726 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SmoP56726 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SmoP56726 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmoP56726 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmoP56726 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmoP56726 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SmoP56726 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmoP56726 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmoP56726 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmoP56726 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SmoP56726 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmoP56726 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmoP56726 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SmoP56726 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmoP56726 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmoP56726 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmoP56726 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmoP56726 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SmoP56726 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmoP56726 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SmoP56726 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SmoP56726 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmoP56726 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmoP56726 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmoP56726 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SmoP56726 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmoP56726 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmoP56726 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmoP56726 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SmoP56726 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmoP56726 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmoP56726 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SmoP56726 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmoP56726 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SmoP56726 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SmoP56726 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmoP56726 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmoP56726 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmoP56726 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmoP56726 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SmoP56726 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmoP56726 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmoP56726 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmoP56726 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmoP56726 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmoP56726 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SmoP56726 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmoP56726 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmoP56726 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmoP56726 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmoP56726 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmoP56726 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SmoP56726 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmoP56726 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmoP56726 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmoP56726 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SmoP56726 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmoP56726 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmoP56726 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmoP56726 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmoP56726 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SmoP56726 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SmoP56726 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmoP56726 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmoP56726 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmoP56726 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmoP56726 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmoP56726 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmoP56726 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmoP56726 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmoP56726 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmoP56726 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmoP56726 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmoP56726 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmoP56726 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SmoP56726 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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