Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn5P54830 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn5P54830 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn5P54830 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms