Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DbtP53395 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbtP53395 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbtP53395 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbtP53395 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbtP53395 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DbtP53395 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbtP53395 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbtP53395 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DbtP53395 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DbtP53395 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DbtP53395 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DbtP53395 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DbtP53395 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DbtP53395 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DbtP53395 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DbtP53395 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DbtP53395 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DbtP53395 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DbtP53395 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DbtP53395 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DbtP53395 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DbtP53395 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DbtP53395 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DbtP53395 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DbtP53395 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DbtP53395 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DbtP53395 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DbtP53395 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DbtP53395 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DbtP53395 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DbtP53395 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DbtP53395 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DbtP53395 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DbtP53395 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DbtP53395 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DbtP53395 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DbtP53395 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DbtP53395 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DbtP53395 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DbtP53395 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DbtP53395 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DbtP53395 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DbtP53395 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DbtP53395 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DbtP53395 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DbtP53395 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DbtP53395 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DbtP53395 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DbtP53395 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DbtP53395 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DbtP53395 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DbtP53395 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DbtP53395 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms