Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CastP51125 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CastP51125 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CastP51125 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CastP51125 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CastP51125 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CastP51125 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CastP51125 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CastP51125 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CastP51125 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CastP51125 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CastP51125 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CastP51125 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CastP51125 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CastP51125 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CastP51125 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CastP51125 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CastP51125 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CastP51125 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CastP51125 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CastP51125 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CastP51125 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CastP51125 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CastP51125 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CastP51125 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CastP51125 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CastP51125 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CastP51125 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CastP51125 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CastP51125 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CastP51125 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CastP51125 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CastP51125 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CastP51125 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CastP51125 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CastP51125 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CastP51125 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CastP51125 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CastP51125 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CastP51125 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CastP51125 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CastP51125 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CastP51125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CastP51125 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CastP51125 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CastP51125 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CastP51125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CastP51125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CastP51125 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CastP51125 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CastP51125 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CastP51125 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CastP51125 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CastP51125 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CastP51125 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CastP51125 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CastP51125 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CastP51125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CastP51125 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CastP51125 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CastP51125 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CastP51125 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CastP51125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CastP51125 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CastP51125 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CastP51125 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CastP51125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CastP51125 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CastP51125 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CastP51125 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CastP51125 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CastP51125 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CastP51125 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CastP51125 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CastP51125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CastP51125 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CastP51125 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CastP51125 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CastP51125 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CastP51125 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CastP51125 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CastP51125 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CastP51125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CastP51125 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CastP51125 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CastP51125 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CastP51125 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CastP51125 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CastP51125 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CastP51125 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CastP51125 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CastP51125 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CastP51125 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CastP51125 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms