Protein–RNA interactions for Protein: P50705

Defa7, Alpha-defensin 7, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa7P50705 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa7P50705 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa7P50705 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa7P50705 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa7P50705 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa7P50705 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa7P50705 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa7P50705 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa7P50705 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms