Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc5P32043 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxc5P32043 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc5P32043 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc5P32043 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms