Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcdP28867 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcdP28867 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcdP28867 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcdP28867 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms