Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aco1P28271 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aco1P28271 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Aco1P28271 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aco1P28271 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aco1P28271 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aco1P28271 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aco1P28271 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Aco1P28271 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Aco1P28271 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aco1P28271 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Aco1P28271 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aco1P28271 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aco1P28271 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Aco1P28271 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Aco1P28271 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms