Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb3P28231 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gjb3P28231 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjb3P28231 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms