Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Eif3aP23116 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Eif3aP23116 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif3aP23116 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms