Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PdgfaP20033 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PdgfaP20033 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdgfaP20033 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203 ms