Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spi1P17433 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spi1P17433 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spi1P17433 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spi1P17433 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spi1P17433 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms