Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Cxcl1P12850 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18,77■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,76■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18,71■□□□□ 0,59
Cxcl1P12850 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18,69■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18,68■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18,66■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18,66■□□□□ 0,58
Cxcl1P12850 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18,66■□□□□ 0,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,4 ms