Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01757 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01757 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01757 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01757 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01757 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01757 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01757 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01757 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01757 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01757 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01757 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01757 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01757 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01757 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01757 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01757 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01757 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01757 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01757 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01757 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01757 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01757 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01757 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01757 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01757 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01757 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01757 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01757 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01757 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01757 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01757 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01757 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01757 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01757 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01757 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01757 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01757 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01757 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01757 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01757 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01757 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01757 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01757 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01757 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01757 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms