Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01650 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01650 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
P01650 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
P01650 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01650 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
P01650 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
P01650 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01650 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01650 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01650 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01650 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01650 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01650 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01650 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01650 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01650 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
P01650 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01650 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01650 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01650 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01650 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01650 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01650 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01650 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01650 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01650 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01650 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01650 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01650 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01650 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01650 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01650 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01650 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01650 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01650 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01650 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01650 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01650 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01650 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01650 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01650 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01650 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01650 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01650 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01650 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01650 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01650 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01650 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01650 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01650 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01650 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01650 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01650 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01650 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01650 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01650 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01650 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P01650 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01650 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01650 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01650 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01650 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01650 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01650 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01650 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01650 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P01650 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01650 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01650 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01650 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01650 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01650 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01650 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01650 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01650 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01650 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01650 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01650 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01650 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01650 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01650 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01650 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01650 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01650 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01650 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01650 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01650 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01650 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
P01650 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01650 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01650 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01650 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01650 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms