Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JtbO88824 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JtbO88824 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JtbO88824 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JtbO88824 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JtbO88824 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JtbO88824 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JtbO88824 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
JtbO88824 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JtbO88824 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JtbO88824 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JtbO88824 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JtbO88824 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JtbO88824 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JtbO88824 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JtbO88824 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JtbO88824 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JtbO88824 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JtbO88824 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JtbO88824 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JtbO88824 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JtbO88824 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JtbO88824 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JtbO88824 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JtbO88824 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
JtbO88824 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JtbO88824 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
JtbO88824 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JtbO88824 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JtbO88824 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JtbO88824 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JtbO88824 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JtbO88824 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JtbO88824 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JtbO88824 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JtbO88824 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JtbO88824 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JtbO88824 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JtbO88824 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JtbO88824 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JtbO88824 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
JtbO88824 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JtbO88824 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JtbO88824 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JtbO88824 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JtbO88824 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JtbO88824 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JtbO88824 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JtbO88824 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JtbO88824 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JtbO88824 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JtbO88824 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JtbO88824 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JtbO88824 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JtbO88824 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JtbO88824 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
JtbO88824 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JtbO88824 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JtbO88824 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JtbO88824 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JtbO88824 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JtbO88824 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JtbO88824 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JtbO88824 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JtbO88824 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
JtbO88824 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JtbO88824 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JtbO88824 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JtbO88824 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JtbO88824 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JtbO88824 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JtbO88824 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JtbO88824 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JtbO88824 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JtbO88824 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JtbO88824 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms