Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dll3O88516 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dll3O88516 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms