Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfrO88507 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfrO88507 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfrO88507 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfrO88507 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CntfrO88507 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfrO88507 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfrO88507 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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