Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk4O88454 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcnk4O88454 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk4O88454 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms