Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klc1O88447 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc1O88447 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klc1O88447 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc1O88447 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc1O88447 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc1O88447 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc1O88447 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc1O88447 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klc1O88447 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klc1O88447 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms