Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx12O70493 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx12O70493 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx12O70493 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx12O70493 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx12O70493 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx12O70493 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx12O70493 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx12O70493 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx12O70493 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx12O70493 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx12O70493 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms