Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pole2O54956 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole2O54956 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole2O54956 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole2O54956 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pole2O54956 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pole2O54956 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole2O54956 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole2O54956 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole2O54956 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole2O54956 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole2O54956 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole2O54956 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pole2O54956 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pole2O54956 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole2O54956 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole2O54956 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole2O54956 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole2O54956 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole2O54956 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole2O54956 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pole2O54956 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole2O54956 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole2O54956 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole2O54956 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole2O54956 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole2O54956 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole2O54956 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole2O54956 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pole2O54956 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole2O54956 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole2O54956 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms