Protein–RNA interactions for Protein: O54940

Bnip2, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip2O54940 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Bnip2O54940 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip2O54940 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip2O54940 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bnip2O54940 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms