Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Limk2O54785 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk2O54785 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk2O54785 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Limk2O54785 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk2O54785 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limk2O54785 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk2O54785 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limk2O54785 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms