Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf12O35738 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf12O35738 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf12O35738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf12O35738 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf12O35738 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf12O35738 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf12O35738 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf12O35738 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms