Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp3O35609 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp3O35609 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp3O35609 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scamp3O35609 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp3O35609 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp3O35609 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp3O35609 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms