Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a6O35544 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a6O35544 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc1a6O35544 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc1a6O35544 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc1a6O35544 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a6O35544 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a6O35544 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a6O35544 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms