Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nedd9O35177 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nedd9O35177 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nedd9O35177 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nedd9O35177 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms