Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-M9O19442 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M9O19442 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M9O19442 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-M9O19442 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-M9O19442 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms