Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PrkcshO08795 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrkcshO08795 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrkcshO08795 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrkcshO08795 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcshO08795 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms