Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp12O08736 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casp12O08736 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casp12O08736 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casp12O08736 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp12O08736 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp12O08736 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp12O08736 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp12O08736 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp12O08736 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp12O08736 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Casp12O08736 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp12O08736 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Casp12O08736 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp12O08736 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp12O08736 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms