Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MttpO08601 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MttpO08601 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MttpO08601 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MttpO08601 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MttpO08601 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MttpO08601 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MttpO08601 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MttpO08601 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MttpO08601 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MttpO08601 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MttpO08601 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MttpO08601 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MttpO08601 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MttpO08601 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MttpO08601 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MttpO08601 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MttpO08601 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MttpO08601 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MttpO08601 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MttpO08601 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MttpO08601 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MttpO08601 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MttpO08601 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MttpO08601 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MttpO08601 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MttpO08601 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MttpO08601 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MttpO08601 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MttpO08601 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MttpO08601 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MttpO08601 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MttpO08601 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MttpO08601 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MttpO08601 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MttpO08601 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MttpO08601 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MttpO08601 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MttpO08601 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MttpO08601 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MttpO08601 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MttpO08601 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MttpO08601 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MttpO08601 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MttpO08601 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MttpO08601 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MttpO08601 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MttpO08601 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MttpO08601 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MttpO08601 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MttpO08601 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MttpO08601 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MttpO08601 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MttpO08601 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MttpO08601 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MttpO08601 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MttpO08601 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MttpO08601 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MttpO08601 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MttpO08601 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MttpO08601 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MttpO08601 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MttpO08601 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MttpO08601 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MttpO08601 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MttpO08601 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MttpO08601 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MttpO08601 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MttpO08601 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MttpO08601 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MttpO08601 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MttpO08601 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MttpO08601 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MttpO08601 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MttpO08601 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MttpO08601 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MttpO08601 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MttpO08601 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MttpO08601 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MttpO08601 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MttpO08601 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MttpO08601 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MttpO08601 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MttpO08601 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MttpO08601 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MttpO08601 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MttpO08601 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MttpO08601 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms