Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc191J3QQ27 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc191J3QQ27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc191J3QQ27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc191J3QQ27 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms