Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21060J3KMU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21060J3KMU4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21060J3KMU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21060J3KMU4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms