Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21411J3KMS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21411J3KMS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21411J3KMS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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