Protein–RNA interactions for Protein: G3XA30

Nsmce4a, MCG1618, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce4aG3XA30 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce4aG3XA30 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce4aG3XA30 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce4aG3XA30 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nsmce4aG3XA30 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce4aG3XA30 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce4aG3XA30 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce4aG3XA30 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce4aG3XA30 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms