Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,31
Trim55G3X8Y1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Trim55G3X8Y1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Trim55G3X8Y1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Trim55G3X8Y1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Trim55G3X8Y1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms