Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700067P10RikG3X8U2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700067P10RikG3X8U2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700067P10RikG3X8U2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms